一、办公室

负责中心文电档案、机要保密、安全保卫、后勤保障等日常运转和综合协调；承担重要文稿起草和政务信息工作；承担中心党群、人事、纪检工作和离退休人员管理工作；承担中心财务、资产管理等工作。

二、资格认证处

承担卫生健康人才培养培训项目统筹办公室工作职能，协助落实全委培训工作统筹；协同开展继续医学教育管理工作，承担远程继续医学教育组织、管理与实施；负责全国继续医学教育公共服务平台的建设与运维，实施远程继续医学教育质量监管与评估，网络平台运维、管理和网络安全防范；负责开展中心培训项目的绩效评价和监督管理工作；负责继续医学教育数据库科研课题研究与资源库建设工作。

三、继续教育处

开展卫生健康系统专业技术人员能力建设，承接政府和社会委托的能力建设项目，组织实施相关培训；开展卫生健康系统职业技能人员能力建设，组织实施相关培训。

四、专业能力处

开展卫生健康系统行政管理人员能力建设，组织实施相关培训；开展公立医院领导人员职业化培训；开展医疗卫生机构能力建设，实施能力评估社会化服务；开展卫生健康行业职业教育组织管理工作。